Le docteur Lemuel Gulliver embarque pour un long voyage et rencontre à bord le jeune Raphaël, orphelin hyper maladroit sans cesse brimé par le capitaine du bateau, avec lequel il se lie assez vite d'amitié. Une nuit, un violent ouragan se déclenche et provoque le naufrage du navire, ne laissant apparemment comme seul survivant que Gulliver, qui s'évanouit au milieu des éléments déchaînés... Ce dernier se réveille alors au matin attaché des pieds à la tête sur une petite plage. Il réalise que ses geôliers sont de drôles de minuscules petits êtres : les Liliputiens, habitants de Liliput.